近年来，水环境综合整治工作作为民办实事项目之一，是市委、市政府将环境保护和改善民生紧密结合的重要体现。

一是加强饮用水源保护，城区集中式饮用水源地达标率为98.31％。开展西北区饮用水源地整治，依法取缔沿岸排污口，全面清理拆除了水源地南岸沿岸的违章建筑，完善污水管道建设。加大环保执法力度，市、区两级环保部门加强对饮用水源保护区的日常巡查，建立健全饮用水安全保障应急机制。逐步开展建制镇饮用水源保护工作，2007年已完成了全市54个建制镇饮用水源区划，2008年计划开展水源保护区的围网、标志牌及整治工作。

二是推进闽江流域水环境综合整治，福州段全年水域功能达标率为100%。针对闽江福州段上游闽清县建陶行业的污染特点，实施全行业的技术改造，对废水、废气、粉尘进行全面治理。加大闽江下游印染业企业的整治力度，目前长乐市印染企业印染废水已全部实现达标排放，部分废水回用率已达到70％，并对印染企业污染治理设施安装视频监控装置，实现远程在线监控。同时，关闭了流域内污染严重的化工企业、小造纸企业、小电镀企业、小建陶企业等20家企业。

三是强化敖江二水源保护，塘坂水库水源地水质达标率为100％。推动库区畜禽养殖搬迁任务，改善区域水环境质量。加快农村环保基础设施建设，完善污染治理设施运行的监管。加强石板材污染综合整治，实行石板材定点生产加工区和限制生产加工区的规范化建设，搬迁、改造、整合提升石板材加工业。